男性患者出现精子头部缺损，原因比较多，可以分为以下几种：
1、由于泌尿生殖系统感染而引起的精子头缺陷，比如支原体及衣原体感染，会影响到精液里面的营养成分，引起精子头部出现畸形，甚至有死亡的精子。
2、精子头部出现缺陷和男性患者不良的生活习惯有关，比如抽烟、经常酗酒等，烟草中的尼古丁会导致精子出现畸形，而且过多的饮酒也会导致精子出现畸形。
除了以上两种原因导致精子头部缺损之外，也可能和患者长期处于化学制剂、辐射以及空气污染的环境里有关。精子头部缺陷要及时就医，避免延误病情及治疗。