新型冠状病毒核酸检测阳性，是确诊新型冠状病毒肺炎的金标准。新型冠状病毒肺炎核酸检测时有时会受到检测试剂以及标本的采集影响，会出现假阴性，所以标本采集时一定要规范的采集，采集之后应该尽快送检。
另外，下呼吸道的分泌物阳性率更高，所以也可以进行痰液的核酸检测，痰液的核酸检测阳性率要高于咽拭子，也高于鼻咽拭子。如果高度可疑似时，一次阴性不能排除新型冠状病毒肺炎，可以反复检测，必要时可以进行新型冠状病毒肺炎特异性抗体IgM和IgG的检测，来辅助诊断。反复进行核酸检测时，每次核酸检测应该间隔24h以上。