胆囊结石如果引起肝功能的异常，需要针对胆囊结石进行积极的治疗。结石合并严重的胆囊炎才会出现肝功能的异常，此时需要给予利胆、解痉、消炎的处理。
如果肝功能异常无法恢复，还需要针对肝脏给予保肝治疗。胆囊结石如果反复发作引起肝功能异常，需要针对胆囊结石进行手术治疗，才能达到根治的效果。
胆囊结石平时也要定期的复查，如果出现严重的并发症，需要给予积极的治疗。此外肝功能的异常，也需要排除一下是否因为其它的原因引起，特别是肝脏本身的疾病，如乙肝、丙肝、肝硬化、脂肪肝等等。