超声波检查简便，经济无创伤可以发现2mm以上的结石，另外还可以了解有无肾积水，间接了解肾实质和肾集合系统的情况。超声波对于输尿管中下段的结石敏感性较低，原因是由于肠道内容物以及骨盆的影响，但是对于肾结石可以作为首选的检查方法。
CT的分辨率较高，可以发现1mm以上的结石，CT不受肠道内容物的干扰，不受结石成分、肾功能和呼吸运动的影响，还可以进行二维或者三维的重建，因此具有很大的优势。另外，还可以通过结石的CT值来初步判断结石的成分，为手术提供参考，但是CT要接受X线辐射。
因此，对于上尿路结石也就是肾结石或者是输尿管上段的结石，彩超可以作为首选的检查方法。对于输尿管中下段的结石、比较大的肾结石需要做手术的患者，可以做CT作为首选的检查。