磁共振检查做完以后患者感觉不舒服，主要的原因可能与以下几个方面有关系：
第一、患者本身的疾病是否会影响患者出现不舒服的症状。
第二、磁共振检查时间相对比较长，会引起人体内的发热，这种发热也会引起患者出现不适的感觉。
第三、磁共振检查的噪音比较大，在一定程度上引起听力的不适，如果患者本身存在听力的问题，那么做完磁共振检查以后也会引起人体头部的不适，像晕船、晕车的患者一样，坐完车以后也会出现类似的症状。