绝经之后的卵巢囊肿是否会自己消失，要根据卵巢囊肿的性质而定。具体如下：
第一、卵巢囊肿分为不同的类型，临床比较常见的卵巢囊肿是卵巢的生理性囊肿。卵巢生理性囊肿往往是由卵巢分泌的激素水平波动造成的，一般会在月经的后半期出现，经过2-3个周期的观察，在月经刚刚结束时进行复查，卵巢囊肿会缩小甚至消失；另外就是在生育年龄出现的卵巢囊肿到绝经后消失，也考虑是卵巢生理性囊肿。
第二、卵巢子宫内膜异位囊肿，也可能会在绝经之后缩小或者消失。卵巢子宫内膜异位囊肿与卵巢的功能有很大的关系，如果在生育年龄由于卵巢功能旺盛所导致的卵巢子宫内膜异位囊肿，在绝经之后当卵巢功能逐渐的衰退，卵巢囊肿内的积血会逐渐的吸收，也有可能会出现卵巢囊肿的自行消失。
第三、如果是卵巢上皮性肿瘤等等的卵巢囊肿，则在绝经之后是不会自行消失的。
因此女性出现卵巢囊肿之后，如果绝经后没有缩小或者消失，一定要进行密切的随访、观察，必要时进行手术治疗。