妥瑞氏综合征的治疗是综合的方法，其中包括药物治疗，也包括一些行为的训练、心理的治疗等等。对于药物的治疗来说，西药一线的用药现在比较多的是硫必利。再有就是像伴有情绪障碍的，可以选择阿立哌唑。而对于中医的治疗，认为妥瑞氏综合征属于肝风证的范畴，在治疗的时候要根据孩子的具体情况来进行辨证究竟是哪一个症型，然后开具相应的中药来进行调理。
除此以外，对于妥瑞氏综合征，中医治疗来说，还包括一些外治的方法，比如可以进行耳穴的贴。再有比较小的孩子也可以进行推拿的治疗，而对于这种发生性的，也可以进行一些穴位的贴敷，同时还有一些导引的方法，比如易筋经、八段锦等等。另外，对于妥瑞氏综合征的治疗，有部分孩子还需要配合着心理的治疗，总之是一个综合的治疗。