胰腺癌和胆管癌的区别主要是从检查的位置、患者的病情，以及在影像学的检查上面有所区分。胆管癌是来源于胆管肿瘤，可以分为肝内胆管、肝外胆管、肝门部胆管，而胰腺癌是来源于胰腺的肿瘤，可以分为胰头、胰颈、胰体、胰尾癌。因为其具体的来源位置不同，因此在影像学的检查上面就可以进行明确的区分，包含B超、CT、磁共振检查，进行综合的判定。
此外，症状也是有所差别的，胰头癌、胰体癌、胰尾癌在早期都没有典型的症状，只有胰头癌，如果引起胆管的压迫可能会引起梗阻性黄疸的症状，后期可能会引起疼痛的症状。而胆管癌有可能在早期就有可能出现黄疸的症状，因为胆管癌如果向腔内生长，在早期就有可能引起梗阻性黄疸的症状，从而能够早期的发现。但某些肝内胆管癌比较难早期发现，其并没有引起阻胆管的梗阻，很少出现黄疸的症状，而且早期也不会出现疼痛的症状，还要根据胰腺癌具体在胰腺的位置，以及胆管癌具体在胆管哪一段的位置进行相应的鉴别。