睾丸结核往往与附睾结核同时发作，所以表现一般是结核性附睾炎和睾丸炎的症状。发病年龄大多数为20-40岁，发展缓慢，表现为阴囊部肿胀、不适、下坠感，附睾尾或者整个附睾、睾丸呈硬结状，疼痛不明显，形成寒性脓肿。如果继发感染，阴囊局部有可能会出现红肿、疼痛，脓肿破溃以后可以形成经久不愈的窦道。
如果是双侧病变，则容易造成不育症，触诊附睾和睾丸常可以摸到硬结。另外，由于男性生殖系统结核常常合并泌尿系统结核、全身性结核的表现，所以可以出现有尿频、尿急、尿痛、尿液呈现浑浊(米汤样)、腰痛、全身低热，以及系统外其它结核的表现，比如肺结核、骨结核、消化道结核、淋巴结核等等症状。