幽门螺杆菌感染可以通过口服四种药物联合用药进行杀菌治疗，也就是通常所说的四联疗法。这四种药包括有一种质子泵抑制剂，常见的有奥美拉唑、雷贝拉唑、泮托拉唑。
两种抗生素，抗生素可以选择阿莫西林、克拉霉素、甲硝唑、红霉素等等，选择其中两种抗生素即可，最好是根据耐药的情况进行选择抗生素。
第四种药是一种铋剂，包括有枸橼酸铋钾或者胶体果胶铋。四种药物联合起来用药可以有效地清除幽门螺杆菌，用药疗程是14天左右，吃完药之后停药1个月再次复查呼气试验，是否仍然存在幽门螺杆菌感染。
如果用药清除幽门螺杆菌之后复查仍然有感染，可以再次用四联的疗法继续清除幽门螺杆菌。