排尿时小便疼痛，则可能的原因如下：
1、急性尿道感染，这时可以造成排尿时小便疼痛，伴有尿道分泌物增多或者排尿灼热、肉眼血尿等。建议进行尿液化验检查或者进行尿道镜检查等，进一步排除是否存在尿道的急性感染。
2、尿道结石，结石梗阻在尿道之内，可以造成排尿刺痛，并且可以伴有排尿时出血的现象。结石堵塞比较明显可以造成排尿困难或者无法排尿的情况，需要进行尿道镜检查明确。
3、性传播的疾病，常常见于不洁的性接触，可以造成淋球菌、支原体、衣原体等感染。感染以后可以造成小便疼痛伴有尿道大量分泌物排出，需要进行相关的性传播学检查进一步排出，比如进行淋球菌培养、支原体、衣原体检查等。