患者乳腺小叶增生的后果主要包括局部的乳腺疼痛或肿块形成，最严重的有可能会继发乳腺癌。对于乳腺小叶增生最常见或最多见症状是疼痛，尤其是月经来潮时症状明显，月经过后症状可缓解或消失。对于单纯仅有乳腺轻微疼痛，没有形成肿块时，一般无需使用药物治疗，通过放松心情，避免进食过于油腻、辛辣、刺激性食物，避免过于劳累，通常绝大多数患者可以获得临床症状的缓解。
除此以外，乳腺小叶增生有可能会继发乳腺肿块，月经来潮时症状明显，周期过后肿块可以缩小，甚至消失。对乳腺小叶增生伴有肿块形成时，经过上述饮食控制，以及避免过于劳累，通常达不到良好的效果，需要口服中成药物，比如逍遥丸或乳癖消，从而使肿块缩小或消失。乳腺小叶增生形成肿块时，通常还需要进一步做彩超检查，并对肿块进行分级。如果分级在Ⅳ级以上，有一定恶变的可能。在临床上，极少数乳腺小叶增生有可能会因肿块长期存在，而继发乳腺癌。