反流食管炎吃抑制胃酸分泌的药物和促进胃肠道蠕动的药物效果比较好，比如兰索拉唑、奥美拉唑、艾普拉唑肠溶片、西咪替丁、法莫替丁、多潘立酮、莫沙必利等，同时还可以搭配一些保护胃黏膜的药物，比如铝碳酸镁、氢氧化铝等，联合用药效果会更好。
反流食管炎患者在治疗前最好进行幽门螺杆菌的检查，一旦发现幽门螺杆菌的感染，则需进行一并治疗，反流食管炎患者除了药物治疗外，还需调整饮食生活方式，少吃多餐，饭后保持直立，适量活动。同时饮食应以清淡为主，戒烟、戒酒，避免浓茶、咖啡等刺激性食物的食用，避免睡前用餐，避免穿紧身衣等。如果反流食管炎通过药物治疗以及调整生活方式仍无法改善，可考虑进行胃底折叠术来进行治疗。