附睾炎常见的并发症有附睾硬结、鞘膜积液和附睾梗阻，附睾炎是一种急性感染，感染严重的时候会形成少量的鞘膜积液，附睾炎经过抗炎治疗以后，大多数人的附睾结节会完全消失，但也有少部分人附睾尾部的硬结是消失不了的，会长期存在，这个也没有关系。
另外，由于感染可能会造成附睾内炎性物质堆积或者阻塞附睾小管，从而导致附睾梗阻，后期在检查精液的时候可能会发现精液中没有精子，这个称为梗阻性无精症。
如果既往有附睾炎的病史，一般首先会考虑是由于附睾炎导致的附睾梗阻。对于鞘膜积液可以在早期进行积极的抗生素治疗，炎症消失以后可能积液也能部分吸收，附睾尾部遗留的硬结有可能会一直存在。如果是附睾梗阻，可以通过显微镜下的输精管附睾吻合术来疏通梗阻，改善患者的生育能力。