对于生殖道支原体感染的治疗方案，推荐的方案是阿奇霉素口服或者多西环素口服，替代方案包括红霉素和左氧氟沙星口服，具体的用法和用量建议在正规医院专科医师指导下应用。患者的性伴侣需要同时检查治疗，在治疗结束前或口服药物治疗的七天内，双方应该避免性接触。同时在生活上应当注意多饮水，避免辛辣、刺激的食物，处理好内裤和被褥等随身物品。
只有症状而无相应体征或实验室证据，不足以作为复发的依据。对于治愈的标准，包括临床症状消失一周以上，尿液澄清、尿道口无分泌物，尿沉渣镜检为阴性，尿道或宫颈刮片涂片为阴性，且支原体检查为阴性。