舌头根部起疱的原因主要有以下几种：
第一、舌根部的味觉乳头发炎，舌根部主要分布轮廓乳头，该乳头发炎后会造成舌根两侧出现红肿凸起且质地较硬，炎症严重也导致颈部淋巴结肿大；
第二、患有疱疹性咽颊炎，该病由疱疹病毒感染引起的，症状是咽颊部出现密集成片的小水疱，治疗上主要以抗病毒治疗为主，可服用抗病毒口服液、板蓝根颗粒等，并且要注意充分的休息，增强机体抵抗力；
第三、患有慢性咽炎和扁桃体炎，这两种炎症会造成舌根部淋巴滤泡增生，引起舌根部起疱，治疗主要是要去除病因后对症治疗，等相应部位炎症消除后，增大的淋巴滤泡会逐渐消失。