反复的口腔溃疡，在临床上称为复发性的口腔溃疡。除在溃疡发作时进行局部的治疗，对症减轻溃疡的疼痛和促进愈合之外，需要全身治疗来针对病因，减少复发和争取缓解口腔溃疡的反复发作。全身治疗主要是要纠正致病的因素，改善患者的免疫状态，从而能够尽量延长间歇期和缩短溃疡期。主要应用肾上腺皮质激素以及免疫抑制剂或者应用免疫增强剂，包括主动免疫制剂或者被动免疫制剂、球蛋白类的药物。另外也有可能是营养状态，可以补充维生素B类药物，也可以补充微量元素。有的患者还需要进行精神、心理因素的调节，缓解压力以及减轻焦虑的状态，也可能对口腔溃疡的反复发作有一定的疗效。