子宫颈腺囊肿，也称为宫颈纳氏囊肿，是绝大多数情况下子宫颈的生理性变化。在子宫颈转化区内鳞状上皮取代柱状上皮的过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口，或者伸入到腺管内部将腺管口阻塞，就会导致腺体的分泌物没有办法充分引流，而形成潴留、囊肿。子宫颈局部损伤或者子宫颈慢性炎症的时候，有可能会使得腺管口出现狭窄，也有可能会导致子宫颈腺囊肿形成。
子宫颈腺囊肿通常不需要给予额外的处理，但是如果是处于深部的子宫颈腺囊肿，在子宫颈表面可能没有明显的异常变化，只是表现成子宫颈的肥大，则需要与子宫颈腺癌予以鉴别。