肝囊肿0.9cm一般并不严重。因为这种情况下，囊肿比较小，绝大多数的囊肿属于先天性的肝囊肿，属于一种先天性的肝内胆管或者淋巴管发育异常形成的囊性结构，里面都是清亮的液体。这种情况下，肝囊肿并不会出现恶变，而且增大速度也很缓慢，并不严重。一般来说，针对比较严重的情况，除非肝囊肿比较大，并且伴有症状，要考虑进行处理，相对比较严重。处理方案可以是B超引导下穿刺抽液，也可以是腹腔镜下的肝囊肿开窗或者去顶术。
如果囊肿内部并不是清亮的液体，而有感染，囊内出血，囊液伴有胆汁，这种情况下，也需要给予手术开窗放置引流，才能达到比较好的治疗效果。此外，如果肝囊肿与胆管相通，反复引起胆管炎难以控制，有可能要做囊肿空肠Roux-en-Y吻合手术，也是相对比较严重，所以总体而言，针对肝囊肿比较小，没有引起相关病症的时候，一般是定期复查随访，暂时不需要特殊处理，除非是一些肝囊肿无法排除恶性疾病，比如属于囊腺瘤或者囊腺癌的情况下，也需要引起重视。