合肥医院综合排名靠前的有安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院、安徽医科大学第二附属医院、合肥市第一人民医院等。 其中安徽医科大学第一附属医院拥有卫生部重点实验室数1个，省部重点实验室数10个，国家药物临床试验机构16个，国家卫健委专科、住院医师培训基地共42个，获批10个国家临床医学研究分中心和5个安徽省临床医学研究中心，2020年度中国医院综合排行榜75位。安徽省立医院连续五年进入“复旦版中国医院排行榜”全国百强，健康管理中心排名全国第2。安徽医科大学第二附属医院是安徽省首家获得JCI认证、全国第十家以学术型医学中心医院通过JCI评审的医院。医院综合诊疗水平高，拥有11个省级临床重点专科，是全国百姓放心示范医院。