济宁综合排名比较靠前的医院有济宁市第一人民医院、济宁医学院附属医院、兖矿新里程总医院等。 济宁市第一人民医院已发展成为鲁西南地区规模最大、学科门类齐全、医疗设备先进、专业特色突出的三级甲等大型综合医院；建立了国内一流的健康管理中心和标准化的ICU、EICU、CCU、RICU病房、病理科及整体供应室；济宁医学院附属医院在心脑血管病的应急救治效率和成人康复诊疗水平处于鲁西南地区领先地位，在微创治疗方面，包括胸腔镜、腹腔镜、胃肠镜、纤支镜、微创椎间盘（孔）镜、关节镜等在内的微创技术已达到国内先进水平。兖矿新里程总医院整合现有学科，着力打造胸痛中心、卒中中心、肿瘤中心、创伤中心、危重孕产妇救治中心、危重儿童和新生儿救治中心等6大中心，加强本部对急危重症的诊治能力，并成立了国际会诊中心和中医中心，具有先进的医疗水平。