没有权威的南阳医院排行榜，比较好的医院主要有南阳市第二人民医院、南阳市第一人民医院、南阳医学高等专科学校第一附属医院等。其中南阳市第二人民医院的心血管内科是省级重点专科，泌尿外科、胸外科等是市级重点专科，麻醉科是市级特色专科，医院拥有中型医疗设备近300台，设备齐全、经验丰富。南阳市第一人民医院的肿瘤科为河南省重点（培育）专科、肿瘤科研团队被河南省科技厅评为省级科技创新型团队。南阳医学高等专科学校第一附属医院是南阳医学高等专科学校直属教学医院，豫西南大型综合诊疗中心，院内微创诊疗技术具有鲜明的特色技术优势和特色学科优势。