安徽医院综合排名靠前的有安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院、蚌埠市蚌埠医学院第一附属医院、安徽医科大学第二附属医院等。 其中安徽医科大学第一附属医院拥有卫生部重点实验室数1个，省部重点实验室数10个，国家药物临床试验机构16个，国家卫健委专科、住院医师培训基地共42个，获批10个国家临床医学研究分中心和5个安徽临床医学研究中心，2020年度中国医院综合排行榜75位。 安徽省立医院在最新一轮（2021年度）全国三级公立医院绩效考核排名第21位，等级A+；医院连续五年进入“复旦版中国医院排行榜”全国百强，健康管理中心排名全国第2。蚌埠医学院第一附属医院作为省级医疗中心，在国家三级公立医院绩效考核中，连续四年位列全国百强。