通辽市的公立医院主要有通辽市医院、内蒙古民族大学附属医院等。 其中，通辽市医院已成为通辽市最大的一所集医疗、科研、教学、保健、康复、体检为一体的国家三级甲等综合医院，医院胸痛中心是国家胸痛总部获批的高级标准版，并经国家胸痛中心总部、自治区胸痛联盟和通辽市卫健委审批，成为通辽区域胸痛中心联盟管理单位；医院卒中中心是国家高级卒中中心，是通辽地区卒中急救地图管理单位。 内蒙古民族大学附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的国家三级甲等综合医院，是全国唯一一家国家级重点蒙西医结合医院，先后荣获“全国百姓放心示范医院”、“全国爱婴医院”、“中蒙医护理先进集体”、“全国民族团结进步模范集体”等荣誉。