安徽比较好的儿童医院有安徽省儿童医院、安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院等。 安徽省儿童医院是集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体三级甲等儿童专科医院。现有国家级新生儿保健特色专科、拥有7个省级临床重点（培育）专科：儿童骨科、新生儿科、儿童心胸外科、儿童康复医学科、儿童肾内科、重症医学科（PICU）、儿童神经内科。在危重新生儿的抢救、小儿脑瘫、癫痫、哮喘、肾病、消化道疾病等方面有很高造诣。 安徽医科大学第一附属医院儿科是安徽省危重新生儿转运救治中心，安徽省临床医学重点学科，安徽省教育厅精品课程。常规开展无痛胃镜、胃肠电生理、肾脏穿刺病理活检、血液净化、肺功能、纤维支气管镜、超声骨密度、新生儿中心静脉置管、新生儿换血、神经电生理检查、遗传代谢病筛查、儿童高级生命支持等临床诊疗项目。 安徽省立医院儿科是集医疗、科研、教学于一体的儿科医学基地，是安徽省医学会儿科学分会主任委员单位。对儿童内科各种常见病、多发病、疑难病、少见病、罕见病、急危重病的诊治有着十分丰富的临床经验。