安徽宿州三甲医院有宿州市立医院、皖北煤电集团总医院，这两个医院是集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救于一体的省级综合性三级甲等医院。宿州市立医院为安徽医科大学附属宿州医院、安徽医科大学硕士培养基地、上海长海医院宿州协作医院、上海交通大学医学院附属仁济医院宿州协作医院、解放军总医院远程会诊和教学医院、安徽省立医院区域医疗中心网络医院、蚌埠医学院教学医院等。皖北煤电集团总医院是宿州市、濉溪县、墉桥区城镇职工医保、城镇居民医保，职工医保、离休干部、车祸伤、工伤、残疾人康复定点医院，蚌埠医学院、安徽医科大学、皖南医学院、安徽中医学院临床教学医院。