亳州比较好的医院为亳州市人民医院、亳州市中医院。亳州市人民医院是国家三级甲等综合性医院，本院的全科医学科、儿科、心血管内科、呼吸内科、骨科、重症医学科、普通外科、神经内科被评为十四五省级临床重点专科。亳州市中医院目前拥有国家中医药管理局农村医疗机构中医特色优势重点专科1个，省级重点专科6个、市级重点专科9个，是安徽省“北华佗、南新安”重点建设单位。