邵阳市三级甲等医院包括邵阳市中心医院、邵阳学院附属第一医院、邵阳市中医医院等。其中邵阳市中心医院有泌尿外科、儿科、护理三个省级临床重点专科和妇科、康复医学科、呼吸内科、普外科、神经内科、神经外科、消化内科、急诊科、感染科、肾内科十个全省市州级临床重点专科。邵阳学院附属第一医院拥有省级临床重点专科3个，省级省临床重点专科建设项目5个，市州级省临床重点专科建设项目9个。邵阳市中医医院肿瘤科、急诊科是国家中医药管理局重点专科，制剂室是国家级中药制剂能力建设项目单位，骨伤科、心病科（心血管）、脑病科、针灸科、肾病科是湖南省中医药管理局重点专科。