乙肝免疫耐受期指高病毒载量，一般乙肝HBV-DNA＞10^7IU/ml。患者肝功能正常，肝穿刺可以发现肝脏没有任何炎症或仅有轻微炎症。如果患者应用抗病毒药物，机体不能很好的达到抗病毒的疗效。只有在机体进入免疫清除期的时候，应用抗病毒药物治疗才能达到较好的疗效。

慢性乙肝HBV-DNA的感染一般分为四个时期，即免疫耐受期、免疫清除期、免疫控制期、感染期。