精索静脉曲张介入治疗并没有绝对的禁忌症，临床上约有10%-20%的患者是由于解剖变异，精索静脉与邻近的静脉间存在有侧支吻合，比如腰静脉、肾上腺静脉、肾包膜静脉以及输尿管静脉的吻合。所以在进行栓塞治疗的时候，因为潜在的异位栓塞，可能会作为一种相对的禁忌症。

另外，对于双肾静脉的畸形，由于手术中导管难以超选择的插入到精索静脉，针对此种情况，一般不主张进行栓塞治疗。如果是患者具有严重的碘过敏反应、严重的感染和凝血功能障碍，也是需要注意的事项。