晨尿一般可以指早上的第一泡尿，是由夜间的肾脏工作产生，而且很多尿液在膀胱里已经储存了一夜，尿中的脱落细胞会最多。因此，对于某些想检查尿脱落细胞中是否有肿瘤，或者看里面是否有一些管型的时候，也就是为了某些肾炎的诊断，这时候才会叮嘱患者取晨尿，即早上的第一泡尿。
但实际上，对门诊患者这样操作，有时候会相对困难，或者只能在一些有条件的体检中心，或者住院时进行检查。所以在临床上，很多时候叮嘱患者，取的晨尿通常是在尿了第一泡尿之后，在2-3个小时之内的尿，也算早晨的晨尿。这主要是为了操作方便，否则很难早上还憋着尿，然后再到医院完成一系列的手续，再去验尿，不太现实。
对于大部分的尿液检查，除了前面提到的脱落细胞、管型，如果只是看红细胞、白细胞，诊断泌尿系感染，实际上任何时间段的尿液都可以。当然，肯定是晨尿效果最好。只是在可操作性上，如果诊断尿路感染等，其实在看门诊的任何时间段，都可以取尿进行检测。
