涎腺囊肿可能是因为涎腺分泌液不能正常排入口腔，引起的潴留性病变。也可能是因为涎腺分泌管出现破裂、漏口，导致分泌的唾液进入周围组织间隙，又因为周围组织的包裹，而形成外渗性囊肿。涎腺囊肿既可以发生在腮腺、颌下腺、舌下腺，也可能发生在小唾液腺。比如最常见的涎腺囊肿发生部位是下唇内侧和舌尖腹侧，这两个部位的涎腺囊肿发生，就是来源于小唾液腺。

小唾液腺来源的涎腺囊肿，通常早期没有明显症状，只看到有鼓包或囊性占位。穿刺时内部通常是黏稠的淡黄色唾液。随着病变发展，囊肿可能破裂有唾液流出，导致囊肿萎缩、变小，甚至完全消失。但随着破裂口的愈合，新的唾液流入囊肿腔，又会形成新的病变。这样反复发生，是涎腺囊肿的典型临床症状。如果发现并证实涎腺囊肿存在，通常需进行局部的切除手术。切除时不仅要切除涎腺囊肿本身，引起涎腺囊肿分泌的唾液腺，通常也需一并切除，才能更好地保证涎腺囊肿的根治，避免术后复发。