花椒水有较好止痒效果。临床上会用花椒配合其它中药，治疗湿疹及肛门瘙痒。例如花椒加蛇床子、地肤子、薄荷、苦参等清热、燥湿、杀虫、止痒药物来外洗。

由于花椒是辛辣刺激食物，需要掌握其浓度，如果外用过浓则刺激皮肤。通常用5-10g左右，煎水、泡洗，一次泡20分钟左右，而且不要用太烫水泡洗，另外要避开眼睛周围及外阴等薄嫩部位，因为花椒有刺激性。如果实在要用，如外阴瘙痒，控制在3-5g。