月经干净后两天又出血主要考虑以下几种原因：

1、因为经期排出不畅，部分积血淤积在宫腔内，未在月经期及时排出。而在月经结束后，由于运动等因素使淤血排出阴道。其次，部分上环的患者或部分剖宫产术后有子宫憩室的患者，也可能会出现月经干净后两天出血的现象；

2、妇科炎症导致生殖道的充血、水肿，长时间充血可能会导致出血；

3、病理现象的异常出血，包括子宫内膜病变、子宫肌瘤、子宫腺肌瘤、排卵障碍等。

建议患者到医院做妇科检查、妇科彩超，根据情况做进一步处理。