直肠如果出现充血、水肿的情况，提示有慢性直肠炎的存在。慢性直肠炎可能与长期便秘或长期腹泻有关系，也有可能存在其它非肠道特异性疾病。在这种情况下，要针对原发疾病，如针对便秘进行治疗，针对腹泻进行治疗。如果还有溃疡性结肠炎、克罗恩病等情况，需经过消化科正规医生的处方进行系统治疗。
医生通常会开出美沙拉嗪等药物，中药在治疗溃疡性结肠炎中也有非常好的效果。医生可能会给患者开具灌肠用的制剂，灌肠这种方式可以直接将药物作用在病变局部，可能效果会更好。