通常认为内科治疗以药物治疗为主，称为内科，外科治疗以手法治疗为主，称作为外科，根据疾病以各种方式治疗为主。外科主要是做手术，以手法治疗为主，内科主要是药物治疗。临床上往往并不绝对，外科除了做手术，也要用药物辅助进行治疗。

内科大夫也做手术，现在很多内镜技术，如胃镜、肠镜等，属于消化内科的范畴，消化内科在进行胃镜和肠镜的检查时，如果有小息肉，可能在肠镜下进行切除，也叫内镜下小手术，还有从鼻腔做支气管镜进行治疗等，也是内科的检查和治疗。内科手术最常见的是心脏内科的冠脉支架手术，也称之为内科的手术治疗。现在外科和内科的区分有交叉的成分，内科医生也需要做手术，使用手法治疗手段。