5岁男孩体检要注意检查以下项目：

1、身高、体重、头围的测量：5岁男孩进行体检时要进行生长发育指标的测量，将上述指标标注在生长发育曲线上，与标准曲线做对照，若发现异常要早期指导并给予纠正；

2、全身体检：要进行心、肺、腹，以及皮肤、黏膜的体检，有助于早期发现问题，进行进一步的检查；

3、外生殖器体检：要注意是否有包皮过长、包茎，或者双侧睾丸下降等情况。如果孩子有包皮过长、包茎，要给予指导，否则容易继发泌尿道感染，出现包皮发炎等，因此要及时给予治疗；

4、血常规：要进行血常规的测定，观察孩子是否有贫血、炎症，以及血小板的异常。如果发现异常，可以进行进一步的诊断和治疗，重点在于早期发现血液方面的疾病。