肛拭子检查主要用于胃肠道感染疾病的诊断，尤其是细菌性痢疾的诊断，是对排不出大便的患者进行检查的手段。肛拭子检查的方法，是将肛管插到肛门内，旋转几下后取肛门内的大便。这种检查方法存在一定的痛苦，尤其对于直肠黏膜病变或痔疮的患者，除疼痛外甚至可以出现出血。

感染中毒型痢疾的患者可以表现为高烧、血压低、神志改变，但没有腹泻症状。这时候需要采用肛拭子的方法，采集大便标本，进行大便常规及细菌培养的检查。若大便内有大量白细胞、少数红细胞，可以帮助临床诊断细菌性痢疾。当然需要细菌培养出痢疾杆菌，才能确诊是细菌性痢疾。