扁桃体结石不会癌变，主要通过清热解毒、抗病毒、手术等治疗方式达到根治。扁桃体结石是扁桃体局部长时间发生炎性病变，导致局部上皮角化形成沙粒样改变，类似结石。扁桃体结石治疗早期可以口服中医药治疗，比如清热解毒的药物，如银花、连翘、板蓝根、大青叶等，也可以口服抗病毒制剂治疗。

扁桃体结石严重者可以进行手术治疗，可以进行局部微创手术、激光或者其它治疗。扁桃体结石一般出现局部咽喉疼痛时，尽早要去相关医院比如耳鼻喉科进行局部检查。如果确诊是结石，可以进行早期治疗，不会对人体出现大危害，也不会发生癌变。