B型流感嗜血杆菌的疫苗主要针对具有荚膜的B型流感嗜血杆菌的感染。流感嗜血杆菌一般包括两种，一种含有荚膜的流感嗜血杆菌，另外一种没有荚膜的杆菌。含有荚膜的流感嗜血杆菌，又根据荚膜表面抗原的不同分为六个血清型，即A、B、C、D、E、F，其中B型致病性最强。
因为荚膜可以抵抗中性粒细胞、吞噬细胞对于流感嗜血杆菌的吞噬，同时具有较强的侵袭力，可以穿透组织进入血液，可以引起菌血症以及败血症。所以B型流感嗜血杆菌相对引起的病情比较重，所以针对B型流感嗜血杆菌研制了疫苗，疫苗注射之后可以防止B型细菌感染菌的感染。
B型流感嗜血杆菌感染之后，临床多见肺炎，另外可以引起脑膜炎、急性会厌炎。会厌炎一般可以引起局部咽部急剧水肿、呼吸困难，严重的可以引起窒息、死亡。另外很容易引起菌血症和败血症，所以有一定病死率。对于B型流感嗜血杆菌感染，最常见的是儿童，一般多见于2个月以上到2岁期间的儿童，感染发生率最高，成人偶尔也可以感染。
