检查支原体和衣原体主要是明确有无尿道炎，在临床医学上称为非淋尿道炎，即非淋菌性尿道炎。非淋菌性尿道炎是一种性传播疾病，也可能通过接触传播，如接触感染者的内衣、内裤，或者分泌物等造成，但以性传播途径为主。
支原体、衣原体是介于细菌和病毒之间的致病微生物，其感染尿道后会造成尿道黏膜的充血水肿，从而造成感觉神经的外露。所以支原体、衣原体感染特征性的表现是尿道外口的瘙痒感严重。
其次支原体、衣原体感染还可导致尿道的分泌物明显增加，且和淋病不同，淋病多表现为尿道外口的黄白色脓液，而支原体、衣原体所致的感染常表现为较稀薄的脓液。可以通过分泌物的病原体检测予以确诊，下一步治疗推荐使用大环内酯类抗生素。
