射精时出现疼痛感，其原因较多，可能包括以下几种：

1、慢性前列腺炎：感染性致病菌刺激前列腺部尿道黏膜，导致黏膜水肿、糜烂，同时引起前列腺腺体炎性肿大，进一步可波及射精管开口，引起输精管发炎，造成精液感染。当精液中致病微生物繁殖后，进入后尿道时会引起后尿道炎症，如果后尿道出现黏膜破损、糜烂，可出现射精后疼痛；

2、尿道炎：包括淋菌性或非淋菌性尿道炎，可导致尿道黏膜水肿、糜烂。射精时精液刺激糜烂的尿道黏膜，会出现疼痛症状，部分患者可出现射精后尿道刺痛或灼热感；

3、后尿道结石：在性活动后可出现射精后尿道疼痛。尿道收缩时由于结石刺激，引起尿道黏膜破损，可出现后尿道疼痛。

出现上述症状时，应及时到泌尿外科就医，予以规范治疗。