打水光针不能过深也不能过浅，应将药物注射到适当层次。有研究表明，注射水光针的理想层次是真皮网状层，或比真皮的网状层略浅。皮肤主要分为表皮和真皮，表皮厚度大概为0.5mm，而全身真皮厚度不等，为0.5-2mm，面部真皮较浅，大概为1mm。如果想要将皮肤营养物质和药物注射到真皮网状层，便要控制注射针头深度。
通常面部注射时，深度控制在1-1.5mm，可以有效将营养成分注入到真皮网状层。如果注射层次过浅，水光针也会有作用，但作用可能接近于无针水光，因注射针只能达到皮肤表皮层，会有一定保湿、提亮肤色的效果，但维持时间较短，大多在1周内消失。如果注射层次过深，超过真皮网状层，皮肤出血可能较多，因真皮网状层有较多血管，刺破血管时会导致淤血、瘀斑增多。此外，注射到真皮深层以下，到达皮下组织时，药物反而不能有效注入到真皮内或反馈到真皮内，皮肤会呈现无效水光的状态。因此注射过深、过浅，都需要医生精确把握。
