混合痔手术不一定有后遗症，需根据手术操作是否得当决定。若痔黏膜、肛门腺等正常结构切除的过多、保留的太少，精细感觉和密封功能会到受影响。损伤肛窦，术后会引起感染，形成肛周脓肿，但只是个别患者会出现。如果切除过多，创面术后会形成瘢痕，创面太大，瘢痕挛缩后会导致肛门狭窄，从而导致导致大便困难、大便变细。术后需要医生定时进行扩肛检查。通常在正规医院、正规操作，没有明显的后遗症。目前手术已经发展多年，比较注意保护肛门的功能。
痔黏膜是人的正常结构，病理性增大、下移才可称为痔疮。痔黏膜是正常结构，不能完全切除，需要适当的保留功能，其在肛门内部起到精细的密封功能、感觉功能。另外齿线处有肛门腺，还有分泌黏液的功能，要注意保护，不能完全破坏。
