结核杆菌侵犯肺称为肺结核，侵犯其它器官，如骨骼、关节、淋巴结、肠道等称为肺外结核。人体除了毛发、牙齿和指甲外，任何组织、器官都可以受到结核杆菌的侵犯而发病。常见肺外结核有骨结核、泌尿系结核、淋巴结核、生殖系统结核和脑膜结核等。
肺外结核中病情最严重的是结核性脑膜炎，致残率、致死率较高，早期诊断、早期治疗可以有效减少致残率和病死率。骨与关节结核好发于儿童和老人，病程长、并发症多。骨关节结核常常影响患者骨骼的正常发育生长，可能引起关节畸形、强直、关节功能的丧失等不同程度的残疾，严重者可造成脊髓压迫、截瘫，甚至危及患者生命。
肺外结核存在于身体的许多部位，但感染途径、表现症状各不相同，诊断方法、检查手段、治疗方法也各不相同，需与很多疾病鉴别，早期诊断困难。虽然肺外结核一般不具有传染性，但可以给人造成痛苦和严重危害，也应当重视，做到早发现，坚持全程、合理化疗。