婴儿查过敏原可以挂变态反应科，如果医院科室划分不精细，可以挂儿童保健科或者小儿内科。婴儿查过敏原的方式主要有以下几种：

1、采静脉血：可以通过采静脉血查过敏原，分为2种实验室检查的手段，一种是测量婴儿血中以IgE介导的过敏反应，上述过敏反应大多数是速发型过敏反应。另外一种检查是测量以IgG介导的过敏反应，上述过敏反应大多是以迟发性IgG介导的过敏原，大多数以食物不耐受的形式出现；

2、皮肤点刺：部分年长的婴儿可以通过皮肤点刺的方式查过敏原，需要在医生的指导下严格把握适应症；

3、握棒：部分婴儿检测过敏原，可能会通过握棒的方式进行检测，相比较点刺和静脉血检测，精确度略差。