如果是扁桃体炎急性发作，病人咽部微痛，但咽东西不受影响。从中医角度讲可能是外感风热导致，治疗要疏风清热、利咽止痛，可用清热解毒、消肿利咽的药物治疗，如蓝芩口服液或中药代茶饮，如板蓝根或菊花、芦根、甘草等代茶饮，大多数患者都能缓解。但如果病人疼痛严重，伴吞咽困难、头痛、发烧，检查提示血中白细胞和中性粒细胞升高，则考虑细菌感染，需静脉点滴抗生素，一般3-5天就可以缓解。
慢性扁桃体炎病人咽部不适，有时候有异物感、少量痰，可以口服中成药治疗，如养阴清肺口服液等。如果病人急性扁桃体炎反复发作，比如有的患者1个月发作1次，每次都发烧，必须得输液才能恢复，这类患者建议手术切除扁桃体，以彻底治愈，如果不切除则会反复发作。若患者扁桃体出现生理性肥大，Ⅱ度或者Ⅲ度，导致病人睡觉打呼噜，影响呼吸和吞咽，也建议手术治疗。若扁桃体炎引起全身的并发症，如类风湿性关节炎、心肌炎、肾炎等，也要手术切除，避免并发症的发生。