同房后的第二天龟头刺痛，通常是由于性生活所导致的包皮龟头炎，这类男性一般平时都存在包皮过长或者包茎的问题。在性生活的过程中，可能由于性活动刺激，导致自身包皮垢里的细菌，造成龟头感染，常见的细菌包括大肠杆菌、金黄色葡萄球菌。
此外，在性生活过程中，也可能是来自于女性阴道周围的细菌或者阴道内的真菌，造成真菌性的包皮龟头炎。在临床上，龟头炎大部分是由细菌感染造成，能占到80%，百分之十几可能是一些真菌感染造成的龟头炎。另外还有一些是来自于其他的一些病原体，比如支原体、衣原体、阴道毛滴虫，相对较少见。
针对大部分细菌感染所致的龟头炎，一般要注意保持龟头的局部清洁，可以使用1∶3000的高锰酸钾溶液每天浸泡龟头，切记高锰酸钾溶液配比不要浓度过高。另外，也可以在龟头表面涂抹红霉素或者百多邦软膏(莫匹罗星软膏)，一般连续应用3天左右，包皮龟头炎所引起的龟头刺痛就会得到很好地控制。
