部分患者脑血管畸形介入手术后可能会出现头痛，引起头痛的原因是由于血管畸形所在的位置，靠近脑膜的血管畸形可能出现头痛。此外，栓塞剂对脑组织有一定刺激，也有一部分患者会出现头痛。

引起头痛最担心的是栓塞后出现出血引发头痛，即脑出血或脑水肿，是栓塞后很严重的并发症，会有头痛的表现，但也有一部分患者栓塞后没有头痛症状。