肾囊肿微创手术方式主要有两种，手术时间根据手术方式确定，具体如下：
1、针对身体健康，比如相对比较年轻，能够耐受手术的患者，建议做腹腔镜囊肿去顶减压。主要手术操作过程是把囊肿比较菲薄的囊壁完全切除掉，把其中的囊液吸净。如果是比较熟练的泌尿外科医生操作，整个手术操作一般在半小时以内；稍微多一点、复杂一点囊肿，在1个小时左右就可以完成；如果囊肿位置比较好做，做的特别好的特别熟练的医生可能10分钟左右就可以完成手术。这是最常用的针对身体健康的患者选择的手术方式。
2、针对比较老龄或者有很多并发症、合并症的患者，往往不能耐受手术，但囊肿长得太大，需要处理，这时可能就会选择超声引导下囊肿抽吸，把囊液抽净后，在囊肿内注射硬化剂，破坏整个囊肿内壁的分泌功能，造成囊肿不再复发或者复发更晚。